Tại hiện trường vụ vi phạm, việc xây dựng vẫn chưa được hoàn tất. Phần tường cạnh cổng chính chùa Kim Liên đã xây dựng xong, nhưng phần trang trí “diềm mái” của bức tường mới hoàn thành ở nửa bên phải cổng, nửa bên trái vẫn đang dang dở. Ngoài ra, chiếc cổng phụ cũng đã bị tháo dỡ hoàn toàn, thay bằng cổng gỗ mới, cao to hơn.

Ngay sau khi nhận được thông tin về vi phạm, Ban Quản lý Di tích, danh thắng Hà Nội đã xuống hiện trường kiểm tra việc “làm mới” một số hạng mục di tích và đề nghị chính quyền địa phương tạm dừng thi công tu bổ. Sư Thích Đàm Thành, trụ trì chùa Kim Liên cho biết, nhận thấy tường bao đã xuống cấp, sợ bị đổ nên nhà chùa đã thuê thợ đập tường cũ đi và xây tường mới để bảo đảm an toàn.

Tuy nhiên, chùa Kim Liên là một trong 12 di tích đầu tiên của nước ta được công nhận là Di tích quốc gia từ năm 1962. Do đó, đây là sự việc nghiêm trọng, thể hiện sự coi thường các quy tắc trong tu bổ. Mặt khác, việc tu bổ đã diễn ra nhiều ngày, nhưng chính quyền địa phương, Phòng Văn hóa – Thông tin quận Tây Hồ cũng không biết.

Trước sự việc này, Sở Văn hóa và Thể thao Hà Nội đã đề nghị UBND quận Tây Hồ phối hợp các cơ quan kiểm tra, xem xét giải quyết, báo cáo tìm hướng giải quyết với những vấn đề vượt quá thẩm quyền.

Mặc dù sai phạm chỉ là một bức tường bị thay mới, song, bức tường chùa Kim Liên là một hạng mục có giá trị rất đặc biệt. Bức tường xây bằng gạch vồ, để mộc, tạo nên vẻ đẹp cổ kính hiếm có. Bức tường xây gạch vồ này hài hòa với tam quan, là ba khối cổng, trong đó, cổng chính gồm bốn mái, hai cổng phụ ba mái, toàn bộ kết cấu gỗ đỡ mái cổng chạm trổ tinh xảo, là một trong những tam quan chùa đẹp nhất nước ta. Tam quan này được sử dụng như một biểu trưng văn hóa của Hà Nội.

Chưa kể, tường mới xây cao hơn tường cũ khoảng nửa mét, làm thay đổi tỷ lệ chiều cao với chiếc cổng cổ, khiến tổng thể không gian bị xấu đi rất nhiều.