Xã Hàm Yên được thành lập trên cơ sở sáp nhập các xã Bằng Cốc, Nhân Mục, Tân Thành và thị trấn Tân Yên. Đây là những địa phương có mặt bằng kinh tế ổn định hơn so với nhiều xã khác của huyện Hàm Yên trước thời điểm sáp nhập. Tuy nhiên, hiện nay trên địa bàn xã vẫn còn nhiều hộ nghèo, hộ cận nghèo ở các thôn, bản gặp không ít khó khăn trong đời sống. Song cũng chính ở những vùng đất này, với sự đồng hành, hỗ trợ từ Chương trình mục tiêu quốc gia giảm nghèo bền vững, nhiều hộ nghèo đã nỗ lực vươn lên, biến khó khăn thành động lực, biến ruộng đồng thành cơ hội